我發(fā)布腦膠質(zhì)瘤組學數(shù)據(jù) 將向全球免費開放
8日,記者從首都醫(yī)科大學附屬北京天壇醫(yī)院了解到,中國腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜計劃(CGGA)數(shù)據(jù)庫近日發(fā)布2000例中國腦膠質(zhì)瘤樣本的功能基因組學數(shù)據(jù)。經(jīng)過15年的臨床標本和組學數(shù)據(jù)積累,目前該數(shù)據(jù)庫日臻完善,全部基因組數(shù)據(jù)向全世界研究者免費開放。據(jù)不完全統(tǒng)計,已有美國、歐洲多家知名研究機構近200篇SCI論文引用該數(shù)據(jù)庫。
CGGA發(fā)起人和創(chuàng)建者、北京天壇醫(yī)院神經(jīng)外科副主任江濤介紹,此次公布的數(shù)據(jù)涉及不同組織病理分類、不同WHO惡性度分級、原發(fā)/復發(fā)配對樣本,還包含了詳盡的臨床數(shù)據(jù),包括患者性別、年齡、放療和化療情況、完整隨訪數(shù)據(jù)等。針對不同組學數(shù)據(jù)特點,研究團隊還開發(fā)了不同的在線分析工具,包括腦膠質(zhì)瘤突變圖譜繪制、基因表達及其DNA甲基化的分布模式展示、相關性分析以及生存分析結果可視化等。
腦膠質(zhì)瘤是成人最常見的顱內(nèi)原發(fā)惡性腫瘤。2004年起,江濤團隊開始致力于中國腦膠質(zhì)瘤生物樣本庫的建立及臨床隨訪數(shù)據(jù)的收集。在神經(jīng)外科專家王忠誠院士的指導下,CGGA于2012年啟動。依托于國家神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心、北京市神經(jīng)外科研究所以及北京天壇醫(yī)院,目前CGGA數(shù)據(jù)庫已經(jīng)成為亞洲乃至全世界最大規(guī)模的腦膠質(zhì)瘤醫(yī)學信息工程。
“我們希望通過基因組學技術分析,全面繪制中國人群的腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜,讓國內(nèi)外更多從事腦膠質(zhì)瘤的研究者可以對數(shù)據(jù)庫進行挖掘利用。”江濤表示,CGGA數(shù)據(jù)庫有助于推動腦膠質(zhì)瘤新型診療模式的發(fā)展,讓更多腦膠質(zhì)瘤患者獲益。(實習記者于紫月)